From BlenderWiki

[edit] Configurando a Cena Padrão

Se você não gostar da cena padrão do Blender, ou gostaria de especificar uma configuração para cada projeto iniciado;

• Você quer salvar sua própria área de trabalho interna do Blender ?

Nenhum problema. Você pode usar todos os arquivos da cena como um padrão quando o Blender é iniciado. Para salvar uma cena como padrão use CtrlU. A cena será copiada então para um arquivo chamado B.blend em seu diretório home ou se estiver usando windows, dentro da localização indicada pelo Blender.

Você pode limpar completamente o projeto de trabalho, indo no Menu File - New, ou pressionando CtrlX. Mas lembre-se de salvar a cena primeiro antes de sair !